五稜郭地区（本町・梁川町）を代表する五稜郭バス停（旧函館市交通局は五稜郭電停前バス停）は、函館市最後の市街地である本町にある。梁川町の商業機能が失われて宅地化したため当バス停が最寄りとなる圏内にしか商業エリアは残っていないが、伝統的に路上の乗り場が点在しており煩雑である上に、五稜郭町にある五稜郭公園へは五稜郭公園入口などの他のバス停の方が近いので注意が必要。

5位函館駅前

若松町にあるバス停

大門地区（若松町・松風町）を代表する函館駅前バス停は、函館市の旧市街地である若松町にある。松風町から地続きである旧市街地の中心寄りに立地し、形状としてはバスターミナルである。

5位十字街（函館市）

末広町にあるバス停

西部地区（末広町・元町）を代表する十字街バス停は、函館市の旧々市街地である末広町にある。旧官公庁街である元町と異なる旧々市街地に立地するものの、伝統的にバスターミナルなどは無く、路上の乗り場のみである。

6位日ノ浜団地

恵山出張所

函館バス日ノ浜団地旋回場（旧函館バス恵山出張所）の所のバス停。現在は大幅減便と系統廃止により椴法華支所前方面とを直接結ぶバスが無くなってしまったほか日ノ浜団地発着の区間便も消滅し、函館バスセンター～日ノ浜団地～恵山御崎のバスが上り（91系統ふれあい湯遊館寄らず）2本と下り（91A系統ふれあい湯遊館経由）3本のみ残存するだけである。

6位昭和ターミナル

昭和出張所

ケーズデンキ函館本店（旧函館バス昭和出張所）の所のバス停。函館バス昭和営業所（旧函館市交通局昭和営業所）にも至近。

6位昭和営業所前

昭和営業所

函館バス昭和営業所（旧函館市交通局昭和営業所）の所のバス停。ケーズデンキ函館本店（旧函館バス昭和出張所）にも至近。

6位日吉営業所前

日吉営業所

函館バス日吉営業所（旧函館市交通局日吉営業所）の所のバス停。区画整理で移設された。

6位駒場車庫前

駒場車庫

函館市企業局交通部駒場車庫（旧函館市交通局駒場車庫）の所のバス停。路上に乗り場がある。

7位昭和（函館市）

昭和の拠点となるバス停

昭和バス停は、美原地区（美原・昭和）の、美原と共に郊外ショッピングエリアである昭和の西端寄りに立地する。このバス停はガス会社前・函館バスセンター・昭和ターミナル・亀田支所前・桔梗・七重浜保育園前・新函館北斗駅・富川会館前など各方面が停車するため、伝統的に路上の乗り場が交差点を跨いで複数に分散している。

7位函館税務署入口

梁川町の拠点となるバス停

テキサス函館（旧パボッツ函館（旧函館西武））の所のバス停。函館税務署入口バス停（旧パボッツ前バス停（旧西武前バス停））は、五稜郭地区（本町・梁川町）のうち（商業機能が辛うじて残っている本町と異なり）商業機能が実質的に失われて宅地化されつつある梁川町に立地しており、店舗敷地内の旋回場は廃止されて現在は路上の乗り場に移設されている。

7位松風町（函館市）

松風町の拠点となるバス停

松風町バス停は、大門地区（若松町・松風町）の、若松町と共に旧市街地である松風町にあるバス停。高盛町へ函館バスの本社および函館営業所（函館バスセンター）が移転する前は松風町が同社の本社の立地する運行拠点であったが、現在は路上に複数の乗り場が分散して設置されるのみである。

7位元町（函館市）

元町の拠点となるバス停

元町バス停は、西部地区（末広町・元町）のうち（旧々市街地である末広町と異なり）旧官公庁街である元町に立地。伝統的に路上の通常のバス停である。

8位湯倉神社前

湯川地区の乗り継ぎ拠点

湯倉神社前バス停は各方面（深堀町・五稜郭方面、花園町・亀田支所前方面、函館大学前・香雪園・榎本町・滝沢町方面、湯川団地北口・湯川団地中央・旭岡中学校前・鉄山方面、根崎・湯の川温泉・根崎保育園前方面、など）に分岐するバス停である。ただし96系統の乗り場は湯川３丁目バス停に名称が分離されたので注意が必要。

8位花園町（函館市）

乗継停留所

花園町バス停は亀田支所前方面・深堀町方面・湯倉神社前方面・日吉営業所前方面が交わる。日吉営業所前方面は団地通経由と団地通寄らずで乗り場が異なるので注意が必要。

8位ガス会社前（北海道）

かつての主要バス停

ガス会社前バス停はかつては主要なバス停の1つだったが、現在は衰退している。ただし系統分岐点なので乗り継ぎ拠点としての機能は残っては居る。

8位湯川３丁目（北海道）

湯川地区の乗り継ぎ対象バス停

湯倉神社前バス停のうち96系統の乗り場が少し離れているため湯川３丁目バス停に名称が分離された。

西部地区の外側寄りである弥生町に立地する、路上の通常のバス停である。かつては函館病院前バス停として市立函館病院の最寄りバス停だった（ただし全便が函館病院前バス停を経由した上で一部の便のみが函館病院入口バス停も経由していた）が、市立函館病院の弥生町から港町への移転に際し函館病院前バス停を公会堂前バス停へ改称し函館病院入口バス停は廃止。この移転の際に旧函館病院前バス停（現公会堂前バス停）を通っていた旧函館市交通局1系統の一部の便を大幅に迂回させて病院移転後の市立函館病院前バス停（函館バスは市立函館病院バス停）へ乗り入れる事として現在に至るので、現在も公会堂前バス停は全便経由し市立函館病院バス停は一部便のみが乗り入れるという形で函館バス43A系統（旧1系統）が引き続き公会堂前バス停を含む同系統沿線と市立函館病院バス停を乗り換え無しで結んでいる。

8位市立函館病院

港町に立地するバス乗り場

弥生町から港町へ移転してきた市立函館病院の、敷地内にあるバス乗り場が、市立函館病院バス停（旧函館市交通局は市立函館病院前バス停）である。移転前の市立函館病院の最寄りだった函館病院前バス停は公会堂前バス停へ改称（一部便のみが乗り入れていた函館病院入口バス停は廃止）され、同バス停を通っていた旧函館市交通局1系統は函館病院入口バス停経由便の廃止と引き換えに市立函館病院前バス停経由便を設定したため、現在も函館バス43A系統（旧1系統）が市立函館病院バス停と公会堂前バス停ならびに各沿線を乗り換え無しで結んでいる。