クレオパトラさんの「全国の水族館ランキング」

鳥羽水族館（とばすいぞくかん、TOBA AQUARIUM）は、三重県鳥羽市に本拠地を置く、日本屈指の規模を誇る水族館である。2015年（平成27年）2月時点の展示生物は約1,200種で、日本国内では最大である。

NIFREL（ニフレル）は、日本の大阪府吹田市千里万博公園内に所在する博物館。水族館を主体として動物園や美術館を融合させた博物館といえる。三井不動産がエキスポランド跡地を再開発した複合商業施設「EXPOCITY」に属する施設の一つである。水族館は、人工海水を使った内陸型で、海遊館が展示プロデュースする。

京都水族館（きょうとすいぞくかん、英語表記：Kyoto Aquarium）は、京都市下京区にある梅小路公園内の水族館。

鶴岡市立加茂水族館（つるおかしりつ かもすいぞくかん）は、山形県鶴岡市にある、同県唯一かつ市立の水族館である。同館は旧加茂町の中心部に近い、日本海に面した岬に建っている。愛称は「クラゲドリーム館」。

のとじま臨海公園水族館（のとじまりんかいこうえんすいぞくかん）は、石川県七尾市の能登島北岸にある水族館である。愛称ならびに通称はのとじま水族館で、公式のウェブサイトや施設案内などではこの名称が使用される。

神戸市立須磨海浜水族園（こうべしりつすまかいひんすいぞくえん）は、神戸市須磨区の須磨海浜公園内にある水族館。愛称「スマスイ」。1957年5月10日に神戸市立須磨水族館として開園（1968年までは交通局の所管だった）。

長崎ペンギン水族館（ながさきぺんぎんすいぞくかん）は、長崎県長崎市宿町にある市立の水族館。1959年に開館した長崎水族館を前身とする。長崎水族館は1998年3月31日に閉館したが、住民などの強い願望と署名の結果、移転・規模縮小の上で2001年4月22日に長崎ペンギン水族館として開館した。

鴨川シーワールド（かもがわシーワールド、Kamogawa Seaworld）は、千葉県鴨川市の東条海岸と国道128号に挟まれて立地する、大規模な総合海洋レジャーセンター・博物館相当施設。グランビスタ ホテル&リゾートが運営している。